Né en région parisienne, Thomas MALLET débute la flûte traversière au CRR de Saint-Maur des Fossés dans la classe de Michel Moraguès, puis celle de Philippe Lesgourgues, où il obtient en 2000 le CFEM mention très bien à l'unanimité.  Afin de poursuivre ses études, Thomas quitte la région parisienne pour s'établir à Rouen ou il obtient en 2005 son diplôme d'ingénieur et exerce depuis chez Axens, filiale de l'Institut Français du Pétrole.  De retour en région parisienne, Thomas reprend alors ses études musicales et intègre la classe d’Oscar Catalan à Boulogne Billancourt.